(몇분의 도움으로 해결되었습니다. 해결법은 댓글을 참고하세요^^)
요즘 하고 있는 일들 중에 하나가 fish virus의 genotyping이다.
국내에서 분리되는 바이러스들과 다른 국가, 지역에서 분리되는 바이러스들의 유전적 차이를 이용한 그룹핑을 하는 것이다.
genotyping을 하다보니 자연스레 phylogenetic tree 작성에 대해 공부도하게되고 (책도 하나 구매해서 부족한 지식을 채우고 있다.) 한동안 사용해보지 않았던 clustalX도 다시 돌려보게 되었다. 현재 사용하고 있는 버전은 clustalX (1.83) 윈도우버전이고 MEGA4를 사용하여 tree를 그린다.
몇일전에 한 지인이 clustalX 2.0 버전으로 muliple alignmet를 할려고 하는데 파일 로드가 안된다고 혹시 아느냐고 물어왔다.
안될리가 있나..하고 직접 2.0 윈도우 버전을 설치하고 (1.8 버전까지는 따로 설치과정없이 다운로드받아서 바로 실행이 가능했는데 2.0 부터는 install 해야한다.) 직접 sequence를 로드해 보았는데 역시나 "can not open file!" 메세지만 계속 뜨고있었다.
" 뭣 때문에 안되는가?"
그러고 보니 일전에 나도 2.0을 설치하고 쓸려고 하다가 이런 현상때문에 다운그레이드해서 1.8을 사용했었던거 같은 기억인 떠오른다. --;;
떨어지는 머리 탓해봐야 의미없는 일이고 구글을 필두로 서칭을 좀하고 clustalX 사이트에서 help 내용을 아무리 읽어봐도 2.0에서 seq. load가 안되는것에 대한 얘기는 없었다.(못찾았을 수도 있다. 알잖는가 떨어지는 머리..ㅋ)
이틀에 걸쳐 틈나는 시간마다 서칭을 해봤지만 결국 "1.8로 쓰세요..." 라는 결론만 내리고 마무리를 했다. 없는데 뭐.. 라고 위안삼으며..ㅎ
그리고 또 하루 후.. 연락을 받았다.
그거..비스타만 된답니다.
좀 허무하지만 결론은 냈다. ClustalX 2.0 버전은 윈도우 Vista에서 작동하능합니다. XP 쓰시는 분들은 저처럼 헤매지 마시고 비스타에서 사용하시길 바랍니다...
Fig. ClustalX (1.83) 실행화면
Fig. ClustalX (1.83)에서 fasta 형식의 파일 load한 화면
Fig. ClustalX (2.0.10) 실행화면
Fig. ClustalX (1.8.3) 버전에서 사용했던 fasta 형식 파일을 로드했을때 뜨는 경고메세지!
이 글은 스프링노트에서 작성되었습니다.
